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Lyo-Ready Genotyping Direct qPCR FFPE

Lyo-ReadyTM 可冻干基因分型FFPE直扩qPCR预混液是专为检测遗传变异,如单核苷酸变异和拷贝数变异而优化的无甘油单管配方,可兼容双标签探针。


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Meridian's Lyo-Ready Genotyping Direct qPCR FFPE

  • 超灵敏、可直接检测低至单个拷贝靶标

  • 对FFPE组织中存在的PCR抑制物具有超强耐受性

  • 紧密的荧光簇,可清晰地区分等位基因,非常适合困难的SNP

  • 可用于液体体系或冻干使用,是高通量或POC检测的理想选择

筛查FFPE肺组织中肿瘤相关的PDGFRA1基因突变

Lyo-Ready Genotyping Direct qPCR FFPE graph
A/使用MDX168提取缓冲液处理含有从肿瘤血管生成相关的PDGFRA1突变肺肿瘤FFPE组织 (突变型),然后取1.3 ng DNA直接进行qPCR检测; 或Qiagen QIAamp DNA FFPE组织提取试剂盒对等量的突变型FFPE组织进行DNA提取,然后分别使用B/ KAPA Probe Force qPCR Mix (Roche)和C/ TaqPath ProAmp Multiplex Master Mix (ThermoFisher)对1.3ng 提纯的DNA进行qPCR检测。纯合子等位基因G (红色),等位基因A (蓝色),杂合子等位基因G/A (绿色),NTC (黑色)和x表示未知。结果显示,与对提纯的DNA检测相比,Lyo-ReadyTM可冻干基因分型FFPE直扩qPCR预混液 (MDX168) 对FFPE组织粗提取物的检测具有更强的等位基因识别和更紧密的簇集。

Lyo-Ready Genotyping Direct qPCR FFPE, MDX168

两种包装形式提供: 5 mL (1,000个反应) 或 50 mL (10,000 个反应)

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SNPs(单核苷酸多态性)或点突变是最常见的遗传变异类型,是构成个体之间表型多样性的主要部分。大多数SNP对健康或发育没有影响,但 是它可以用于预测个体对某些药物的反应(药物遗传学),对环境因素(如毒素)的敏感性,以及致病风险(诊断学),也可以用来追踪家族内疾病相关基因变异的遗传。 血液是诊断中最常用的样本类型,是基因分型分析的理想来源。但是,福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)肿瘤组织也依然被广泛使用,由于可以在室温下长期保存,为回顾性研究提供了宝贵资源。但是FFPE样本由于DNA的交联和断裂,获得的DNA产量和质量可能很差。尽管通过长时间的操作,从FFPE样本中提取的DNA进行基因分型检测的成功率仍然很低。 为了简化从FFPE样本中提纯DNA的步骤,迈迪安全新开发了Lyo-ReadyTM可冻干基因分型FFPE直扩qPCR预混液,可以在单管中进行消化组织释放核酸,而不需要进一步提纯,大大降低了样品损坏、丢失和污染的风险,同时简化和加速检测过程。此外,该试剂既能用于液体体系也能通过冻干用于开发常温稳定的检测,是用于高通量检测的理想选择。

常见问答: Lyo-Ready 可冻干基因分型血液直扩qPCR预混液

等位基因区分是在一个特定的基因位点上区分两个或多个序列变化的方法。通常,一个等位基因(“野生型”DNA序列)是常见的,而其他等位基因(突变)是罕见的。在一个SNP中有3个基因型:一个二倍体纯合子(两个野生型等位基因(PP)),一个二倍体纯合子(两个突变型等位基因(PP))和一个杂合子(一个野生型等位基因和一个突变型等位基因(PP))。

SNPs(单核苷酸多态性)有助于预测个体对某些药物的耐药性或易感性(药物遗传学),对毒素等环境因素的易感性,以及致病风险风险。SNPs也可以用来追踪家族内疾病相关基因变异的遗传。

qPCR (Real-time PCR)可以帮助筛查已知的SNPs。qPCR的优点是简单、准确,并且可以进行高通量检测,生物信息学分析也不像测序和微阵列等其他技术那么复杂。

5 ' -核酸酶(TaqMan)等位基因鉴别使用一对引物来扩增目标区域和两个等位基因特异性探针来检测目标SNP等位基因,从而可得知样本的基因型。与正常的qPCR不同,在基因分型中,扩增子的荧光值仅在PCR结束时测量,结果显示在散点图上,因此可以允许上百个检测同时进行检测。

FFPE样本受到多种因素的影响,比如说固定时导致DNA交联、组织固定的时间、年份长短和组织的储存条件。这这些因素导致从FFPE样本中提取DNA很耗时耗力,提取出的DNA容易出现碎片化,用来做基因分型检测的成功率很低。

是的,Lyo-Ready 基因分型血液直扩qPCR预混液可以用于液体体系或通过冻干后才常温下进行储存,不会影响反应的灵敏性,不需要改变反应条件。

可以单独采购MDX004 Tissue Extract-PCR Buffers

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